Depende como distribuyas tus objetivos en el macrociclo. Pero en general el mesociclo dura de 2 a 3 meses dependiendo el autor.
En lo personal, generalmente hago mesociclo de 3 meses para no tener lugar a dudas de que tanto músculos, artículaciones y sistema nervioso está bien adaptado a los ejercicios que realicé durante ese mesociclo, y así puedo pasar a una siguiente etapa.
Sin embargo, depende mucho si entrenas a una persona para simplemente recomposición corporal o si es para un deporte en sí, si es para un deporte, tu mesociclo (así como toda tu periodización) va a depender mucho de sus programas competitivos y te tienes que adaptar a ellas.